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不明能源「盖塔射线」从宇宙的另一端发射而来。在以早乙女博士为首的科学家研究盖塔射线时，不明宇宙生物「侵略者」袭击了地球。
科学家制造出能利用盖塔射线的超级机器人「盖塔机器人」，驱逐了侵略者。
然而，盖塔小队的队长流龙马却因谋杀早乙女博士的罪名被捕入狱。
三年后，本该在此前的战争中绝迹的侵略者再次出现在地球，而应该已经被杀死的早乙女博士也复活，率领盖塔G军团背叛人类。
遭到牢狱之灾的龙马为了报仇，再次坐上盖塔机器人，与盖塔G军团战斗。
然而，盖塔G在战斗中合体，成为真龙。国际机密联盟为消灭真龙发射了重氢核导弹。
为了阻止导弹发射，龙马一行人驾驶新的盖塔机器人「真盖塔」出战。